Keragaman  Jamur Mikoriza Arbuskular pada Rizosfer  Tiga Varietas  Tanaman Tebu

Zulfa Fatmawati; Jaka Widada; Donny Widianto; Anjar Cahyaningtyas; Devanda Ayu Lidya Permata Putri

doi:10.20527/actasolum.v3i2.3293

Zulfa Fatmawati Program Studi Ilmu Tanah, Fakultas Pertanian Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Yogyakarta, Jl. Padjajaran No. 104 Ngropoh, Condongcatur, Kec. Depok, Kab. Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta, 55283 Indonesia
Jaka Widada Program Studi Mikrobiologi Pertanian, Fakultas Pertanian, Universitas Gadjah Mada, Jl. Bulaksumur, Caturtunggal, Kab. Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta, 55281, Indonesia
Donny Widianto Program Studi Mikrobiologi Pertanian, Fakultas Pertanian, Universitas Gadjah Mada, Jl. Bulaksumur, Caturtunggal, Kab. Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta, 55281, Indonesia
Anjar Cahyaningtyas Program Studi Ilmu Tanah, Fakultas Pertanian Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Yogyakarta, Jl. Padjajaran No. 104 Ngropoh, Condongcatur, Kec. Depok, Kab. Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta, 55283 Indonesia
Devanda Ayu Lidya Permata Putri Program Studi Ilmu Tanah, Fakultas Pertanian Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Yogyakarta, Jl. Padjajaran No. 104 Ngropoh, Condongcatur, Kec. Depok, Kab. Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta, 55283 Indonesia

DOI: https://doi.org/10.20527/actasolum.v3i2.3293

Keywords: Arbuscular mychorrhizal fungi, Identification, Nested Polymerase Chain Reaction, Rhizosphere, Sugarcane

Abstract

Jamur Mikoriza Arbuskular (JMA) merupakan kelompok jamur yang dapat bersimbiosis dengan lebih dari 80% akar tanaman. Hubungan simbisosis ini mampu meningkatan serapan hara dan ketahanan tanaman terhadap cekaman lingkungan. Macam dan jumlah JMA sebagai simbion sangat dipengaruhi oleh tanaman inangnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi jenis-jenis JMA pada berbagai varietas tebu (Bululawang, Kidang Kencana, dan Pasuruan Jengkol 922) yang ditanam pada lokasi dan tanah yang sama. Spora JMA diisolasi dengan metode penyaringan basah secara bertingkat. Proses identifikasi dilakukan dengan pengamatan mikroskopik terhadap morfologi spora yang telah diberi pewarna PVLG dan reagen Melzer. Identifikasi molekuler melalui analisis sekuens gen rRNA menggunakan metode nested PCR dengan pasangan primer NS1 dan NS4 dilanjutkan dengan pasangan primer AML1-AML2. Berdasarkan hasil penelitian menunjukkan keanekaragaman spora terbesar genus JMA ditemukan pada tanah varietas Kidang Kencana yaitu 269 spora (berbeda nyata dengan uji DMRT, p<0.05) diikuti varietas Bululawang dengan jumlah spora 191 dan Pasuruang Jengkol 922 dengan jumlah spora 142. Angka keanekaragaman JMA pada tanaman tebu tergolong sedang, dan terdapat empat spesies JMA yang berhasil diidentifikasi secara morfologi dan molekuler, yaitu Glomus flavisporum, Acaulospora koskei, Gigaspora Margarita, dan Scutellospora savannicola. Temuan ini menunjukkan bahwa jumlah dan jenis JMA yang berasosiasi dengan akar tanaman tebu dipengaruhi oleh varietas tanaman, dan Glomus sp. merupakan kelompok yang mendominasi tiga varietas tanaman tebu yang diteliti.

References

Al-Hinai, A., Janke, R., Sieverding, E., Farooq, M., dan Menezes-Blackburn, D. 2025. Identification and characterization of native arbuscular mycorrhizal fungi in plants growing under organic and conventional farming conditions in Oman. Soil and Environmental Health, 3(2), 100140. https://doi.org/10.1016/j.seh.2025.100140

Arofatullah, N. A., Kabirun, S., Fujiyama, K., dan Widianto, D. 2019. Molecular identification and in vitro propagation of arbuscular mycorrhiza from tea plant rhizosphere. Current Research in Environmental and Applied Mycology, 9(1), 92–102. https://doi.org/10.5943/cream/9/1/10

Astuti, A., Mulyono, Haryono, dan Putri, A. E. 2020. Compatibility and effectivity of various mycorrhizal sources with cassava varieties in Gunungkidul. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science, 458(1). https://doi.org/10.1088/1755-1315/458/1/012005

Diédhiou, A. G., Borges, W. L., Sadio, O., dan de Faria, S. M. 2014. Assessment of DNA extraction methods for detection of arbuscular mycorrhizal fungi in plant roots by nested-PCR. Acta Scientiarum - Biological Sciences, 36(4), 433–441. https://doi.org/10.4025/actascibiolsci.v36i4.21689

Green, M. R., dan Sambrook, J. 2019. Nested polymerase chain reaction (PCR). Cold Spring Harbor Protocols, 2019(2), 175–179. https://doi.org/10.1101/pdb.prot095182

Halimah L. S. 2019. Identifikasi dan Karakterisasi Mikoriza Pada Tegakan Nyatoh (Palaquium sp.) Identification and Characterization of Mycorrhizae on Nyatoh (Palaquium sp.) Stands. Jurnal Perennial, 15(1), 51–57. Retrivied from http://journal.unhas.ac.id/index.php/perennial

INVAM. 2025. Acaulosporaceae Gerd. & Trappe. The University of Kansas. Retrivied from https://invam.ku.edu/acaulosporaceae

Kang, Y. H., Jiang, S. T., Wang, Q., Nong, Y. J., Song, J., Li, D. P., Wen, Y. Y., Xu, J., Chen, T. S., Zhang, J. L., dan Li, Y. R. 2024. Response Of Soil Arbuscular Mycorrhizal Fungal Community To Chemical Fertilization In Sugarcane. PeerJ, 12(6), 1–20. https://doi.org/10.7717/peerj.17610

Kartikawati, R., Hanudin, E., dan Purwanto, B. H. 2019. Physico-Chemical Properties of Volcanic Soils under Different Perennial Plants from Upland Area of Mt. Merapi, Indonesia. Planta Tropika: Journal of Agro Science, 7(1), 93–102. https://doi.org/10.18196/pt.2019.098.93-102

Lee, J., Lee, S., dan Young, J. P. W. 2008. Improved PCR primers for the detection and identification of arbuscular mycorrhizal fungi. FEMS Microbiology Ecology, 65(2), 339–349. https://doi.org/10.1111/j.1574-6941.2008.00531.x

Lisek, A., Paszt, L., dan Kulisiewicz, A. 2011. Wykrywanie obecności arbuskularnych grzybów mikoryzowych w korzeniach truskawki technika zagnieżdżonego PCR. Vegetable Crops Research Bulletin, 75(1), 91–103. https://doi.org/10.2478/v10032-011-0021-7

Manaroinsong, E., dan Lolong, A. A. 2016. Identifikasi Cendawan Mikoriza arbuskular (CMA) pada Beberapa Tekstur. Buletin Palma, 16(2), 203. https://doi.org/10.21082/bp.v16n2.2015.203-210

Mistry, J. T., Bijalwan, A. S., dan Thakkar, Y. R. 2023. Evaluating the Influence of Commercial Arbuscular Mycorrhizal Fungi (Greenical VAMTM ) on Sugarcane Growth and Yield. Indian Journal Of Science And Technology, 16(44), 3971–3977. https://doi.org/10.17485/ijst/v16i44.2499

Morton JB, M. Z. 2010. Phylogenies from genetic and morphological characters do not support a revision of Gigasporaceae (Glomeromycota) into four families and five genera. Mycorrhiza, 20(7). https://doi.org/10.1007/s00572-010-0303-9

Nurnasari, E., dan Djumali. 2019. Determination of Soil Moisture Duration before Harvesting that Influences the Sugarcane Content. Jurnal Ilmu Pertanian Indonesia, 24(2), 127–134. https://doi.org/10.18343/jipi.24.2.127

Nurtjahyani, S. D., Oktafitria, D., Sriwulan, Ashuri, N. M., Cintamulya, I., dan Purnomo, E. 2018. Identifikasi dan Karakterisasi Keanekaragaman Mikoriza pada Lahan Reklamasi Bekas Penambangan Batu Kapur di Kabupaten Tuban. Prosiding Seminar Nasional Hayati, 6 (September), 293–299. https://doi.org/10.29407/hayati.v6i1.632

Powell, J. R., dan Rillig, M. C. 2018. Biodiversity of arbuscular mycorrhizal fungi and ecosystem function. New Phytologist, 220(4), 1059–1075. https://doi.org/10.1111/nph.15119

Prayoga, M. H., dan Prasetya, B. 2021. Eksplorasi Mikoriza Arbuskula Indigenous Pada Rhizosfer Vegetasi Lahan Pascatambang Batubara. Jurnal Tanah Dan Sumberdaya Lahan, 8(2), 349–357. https://doi.org/10.21776/ub.jtsl.2021.008.2.6

Riajaya, P., dan Kadarwati, F. 2016. The Suitability of Sugarcane Variety Ripe Types in Heavy Textured, Rainfed, and Smooth Drainage Land Typologies. Buletin Tanaman Tembakau, Serat Dan Minyak Industri, 8(2), 85–97. Retrivied from http://ejurnal.litbang.pertanian.go.id/index.php/bultas/article/view/5265/5241

Rini, M. V., Yelli, F., Tambunan, D. L., dan Damayanti, I. 2021. Morphological and molecular identifications of three native arbuscular mycorrhizal fungi isolated from the rhizosphere of elaeis guineensis and jatropha curcas in Indonesia. Biodiversitas, 22(11), 4940–4947. https://doi.org/10.13057/biodiv/d221128

Rosas-Moreno, J., Walker, C., Duffy, K., Krüger, C., Krüger, M., Robinson, C. H., dan Pittman, J. K. 2023. Isolation and identification of arbuscular mycorrhizal fungi from an abandoned uranium mine and their role in soil-to-plant transfer of radionuclides and metals. Science of the Total Environment, 876 (January). https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.162781

Souza, T. 2015. Handbook of arbuscular mycorrhizal fungi. Springer International Publishing. https://doi.org/10.1007/978-3-319-24850-9

Sukarman, S., Dariah, A., dan Suratman, S. 2020. Tanah Vulkanik di Lahan Kering Berlereng dan Potensinya untuk Pertanian di Indonesia / Volcanic Soils in Sloping Dry Land and Its Potential for Agriculture in Indonesia. Jurnal Penelitian Dan Pengembangan Pertanian, 39(1), 21. https://doi.org/10.21082/jp3.v39n1.2020.p21-34

Sulaeman, Suparto, dan Eviati. 2005. Petunjuk Teknis Analisis Kimia Tanah, Tanaman, Air, dan Pupuk. Balai Penelitian Tanah. Bogor. Indonesia. Retrivied from https://repository.pertanian.go.id/bitstream/handle/123456789/14959/juknis_kimia.pdf?sequence=1

Taylor, D. L., Walters, W. A., Lennon, N. J., Bochicchio, J., Krohn, A., Caporaso, J. G., dan Pennanen, T. 2016. Accurate estimation of fungal diversity and abundance through improved lineage-specific primers optimized for Illumina amplicon sequencing. Applied and Environmental Microbiology, 82(24), 7217–7226. https://doi.org/10.1128/AEM.02576-16

Wardhika, C. M. 2016. Potensi Jamur Mikoriza Arbuskular Unggul Dalam Peningkatan Pertumbuhan Dan Kesehatan Bibit Tebu (Saccharum officinarum L.). Ilmu Pertanian (Agricultural Science), 18(2), 84. https://doi.org/10.22146/ipas.9088

Yakop, F., Taha, H., dan Shivanand, P. 2019. Isolation of fungi from various habitats and their possible bioremediation. Current Science, 116(5), 733–740. https://doi.org/10.18520/cs/v116/i5/733-740

Keragaman Jamur Mikoriza Arbuskular pada Rizosfer Tiga Varietas Tanaman Tebu

Diversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi in the Rhizosphere of Three Sugarcane Varieties

Abstract

References